La collezione di incisioni custodita nell’archivio del museo è formata da un nutrito gruppo di tavole stampate in Europa che Antonio Raimondi utilizzò come materiale di riferimento, nonché dalle incisioni prodotte a Lima dall’Ufficio di Redazione sotto la sua direzione, il cui scopo era illustrare i contenuti di El Perú, la sua opera sulla storia naturale del Paese.